아이팟은 아이튠즈라는 독자적인 프로그램을 이용하여 디렉토리 관리를 합니다. 아이튠즈에 태그나 곡명, 자유로운 분류를  손쉽게 할 수 있는 기능을 가지고 있구요.. 아이튠즈 이외에도 몇가지 프로그램을 사용할 수 있습니다. 플레이어 메모리에 집적 접근해서 곡을 옮기는 방식은 파일수가 비교적 적을때는 편리하지만 양이 많아지고 체계적으로 관리할때는 오히려 불편하다고 생각하고 있습니다. 자세한 내용은 www.withipod.net 을 참고해보세요.