차체가 휘었다면 바퀴가 어케 되냐면요..
바퀴 앞쪽이 왼쪽으로 치우쳤다면 바퀴 뒷쪽은 오른쪽으로 치우치죠
(위아래도 서로 반대방향으로)

이런것이 아니라면 빌딩을 잘못 하셨을겁니다.

참고로 림돌이(휠뷜더용 툴)로 센터를 잡는다 하더라고 각각의 프레임 제조사마다
스윙암 혹은 싯+체인 스테이트의 센터 위치가 다른경우가 흔합니다.

이럴경우 천상 프레임에 맞춰야 합니다.

다시 한번 자세히 봐보세요.
프레임의 드롭풋을 갈아낸다는것은 자칫 잘못 갈리면 허브가 완전히 트러져버릴수 있는 일입니다.

제 생각에 뒷바퀴 휠셋을 재조립 하신것 같은데, 좌우를 바꿔서 휠셋을 프레임에 조립해 보시기 바랍니다. 일반적으로 뒷바퀴의 경우 좌우의 스포크 길이가 다릅니다.
당연히 스포크 장력도 차이가 나고요, 그냥 같은장력으로 조이셨다면 왼쪽으로 치우치게 됩니다. 오른쪽 스포크를 조여서 센타를 맞추는게 정상입니다.
질문하신내용으로 봐서는 어느정도 기계다루는 능력은 있으신것 같은데 정확한 방법은 모르고 계신것 같군요
휠빌딩을 검색해 보세요, 초보자가 하기에는 조금 어려운게 휠빌딩입니다.