어떤 상황인지는 모르겠는데요. 보통 같은 방식의 아답터라면 거의 비슷하거나 미세하게 차이가 납니다.( 캘리퍼의 구조에 따라 조금씩)   보통 같은 방식의 아답터라면 이러한 변수를 와셔를 이용해 조정합니다. 혹은 갈아내기도 하구요.

좌우가 센터가 안맞는 다는 것인지요? 아니면 로터와 캘리퍼의 상하위치가 안맞는 건지요.

좌우 센터라면 상황에 따라 갈아내거나 (아답터) 와셔를 이용해 조정하면 됩니다.

IS 마운트를 사용하는 구형 마죠끼 모델은 BB7같은 기본 포스트+IS 방식의 마운트를 쓸 경우에

로터와 캘리퍼의 간격이 맞지 않는 문제가 종종 있는데(8"로터 사용시)

정품 마죠끼 샥에는 그 간격을 해결해주는 약 4mm정도 두께의 전용 스페이서가 들어있습니다. 

저는 예전에 v브레이크의 콘와셔를 적당히 써서 해결했습니다.  

 (조금 수정 했습니다)